Cela fait 6 ans que la vague mortelle a détruit tout sur son passage, laissant derrière elle une Clarke, seule, essayant tout pour survivre, tandis que ses amis sont éparpillés dans le bunker et dans l'espace. Mais une nouvelle menace fait son apparition : un vaisseau d'anciens prisonniers cryogénisés débarque sur Terre afin de reconquérir le seul endroit viable de la Terre, Shallow Valley.